Um lago típico possui zonas distintas de comunidades bióticas relacionadas à sua estrutura física. A zona litorânea fica próxima ás margens e onde a luz solar penetra até o fundo, permitindo assim a existência de plantas aquáticas ou macrófitas (emersas, flutuantes e submersas) e delimitando a zona eufótica. A zona bêntica é formada pelos sedimentos e detritos que se acumulam no fundo do lago ou reservatório.
As principais comunidades bióticas são as seguintes:
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A biota é de fundamental importância para o estudo e o controle dos metais pesados e outras substâncias tóxicas inorgânicas presentes nos sistemas lacustres. Micróbios, plantas e animais desempenham papéis significativos na determinação do transporte, formas químicas e transferência de metais para diversos locais, porém o fator mais importante é o efeito dessas substâncias.