Órgãos executivos de coordenação e supervisão diretamente vinculados à Reitoria. A UFRRJ possui, em sua estrutura, seis Decanatos. Em outras universidades são conhecidos como pró-reitorias.

O Decanato de Assuntos Administrativos (DAA) dirige, orienta, aprova e fscaliza todas as atividades de pessoal e patrimônio. É integrado pela Secretaria Administrativa, o Departamento de Pessoal e Setor de Patrimônio (Sala 77 do Pavilhão Central).

O Decanato de Assuntos Financeiros (DAF) coordena as atividades fnanceiras. São integrantes do DAF: a Secretaria Administrativa, o Departamento de Material e Serviços Auxiliares, o Setor de Administração de Residências e Pontos Comerciais, o Departamento de Contabilidade e Finanças (Sala 104 do Pavilhão Central).

O Decanato de Assuntos Estudantis (DAE) mantém, coordena e supervisiona as atividades relativas
à permanência e qualidade de vida dos discentes, tais como residência estudantil e apoio alimentar, médico e social aos alunos da Universidade, estando sob sua responsabilidade o restaurante universitário, os alojamentos masculinos e femininos. O DAE promove a concessão de bolsas de alimentação, destinadas apenas aos estudantes carentes de recursos fnanceiros e são concedidas
pela Seção de Bolsas de Alimentação (Sala 37 do Pavilhão Central).

O Decanato de Ensino e Graduação (DEG) supervisiona e coordena todas as atividades relativas ao ensino de graduação. É integrado pela Secretaria Administrativa, o Núcleo de Apoio Acadêmico e Pedagógico e o Departamento de Assuntos Acadêmicos e Registro Geral (DAARG). O acompanhamento da sua vida acadêmica, desde a admissão e matrícula até o registro de seu diploma é feito através da Divisão de Matrículas e pela Divisão de Registros Acadêmicos. (Salas 92-96 do Pavilhão Central).

O Decanato de Extensão (DExt) dirige, programa e organiza as atividades de integração da Universidade com a sociedade. A extensão promove estratégias, programas, projetos e métodos para que a Universidade se articule ante aos problemas sociais, buscando soluções através de pesquisas e realimentando o seu processo de ensino-aprendizagem. O DExt também é responsável por tudo que é relativo ao estágio não curricular (Sala 67 do Pavilhão Central).

O Decanato de Pesquisa e Pós-Graduação (DPPG) supervisiona e coordena todas as atividades relativas ao ensino de pós-graduação e à pesquisa. É composto pela Secretaria Administrativa, Divisão Acadêmica, Núcleo de Apoio à Pesquisa, Programa Institucional de Capacitação Docente e Técnica e a Editora da Universidade Rural (EDUR). Coordena também o PIBIC-CNPq/UFRRJ, Programa de Bolsas de Iniciação Científca. Através deste programa você pode se candidatar à bolsa de Iniciação Científca (Sala 117 do Pavilhão Central).